スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 - PC Watch
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html
スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 - PC Watch
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俺でもできるわ
日本すごい！
10日もかかるの！？
チョン発狂
効くかどうかもわからん候補挙げるなら誰でも出来るだろ
富岳三十六系にゃ
幼稚園児でもできるのでは？？
スパコン必要か？
いきなり日本のスパコンが世界で1位取れると思えないんだけどなんかからくりがあんのかな
w1132060732110711国】雲南から出稼ぎに出た労働者が「ハンタウイルス」に感染し、発症後わずか３時間あまりで死亡 (1002ﾚｽ)
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1(29): のどか ★ 04/07(火)20:27 ID:v7plhaXs9(1) AAS
新型コロナウイルスの流行のピークを過ぎたとみられる中国では、先月23日、雲南省から出稼ぎに出た労働者が、ネズミが媒介する「ハンタウイルス」に感染し、発症後わずか3時間あまりで死亡する事件があった。同僚2人も感染の疑いが持たれている。
画像ﾘﾝｸ[jpg]:www.hazardlab.jp
ハンタウイルスに感染した患者の幹細胞（CDC）
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1(29): のどか ★ 04/07(火)20:27 ID:v7plhaXs9(1) AAS
新型コロナウイルスの流行のピークを過ぎたとみられる中国では、先月23日、雲南省から出稼ぎに出た労働者が、ネズミが媒介する「ハンタウイルス」に感染し、発症後わずか3時間あまりで死亡する事件があった。同僚2人も感染の疑いが持たれている。
画像ﾘﾝｸ[jpg]:www.hazardlab.jp
ハンタウイルスに感染した患者の幹細胞（CDC）
やったー絞り込めてきたー！
富岳「何言ってんだいドク、日本製は最高さ！」
一年半かかってたものが10日でできるようになって調整すれば2日間にまで縮められるってすごくね？
お前らちゃんと評価しろよ
-----
いままでの常識では、創薬は約10年の時間がかかり、コンピュータの役割は候補薬をフィルタリングすることに、1〜2年をかけて貢献していた。だが、新型コロナウイルスは即応性が必要であり、それに対して成果をあげることができた。創薬研究の方法論としては活気的なものである」とコメントした。
「GROMACSは、富岳用にはチューニングをしていない。だが、GENESISをチューニングした実績をもとにすれば、GROMACSもチューニングによって、5〜10倍速くなることを見積もっている。今回は約2,000種類の評価に10日間かかったが、これが2日間で終わるようになる」とした。
お前らちゃんと評価しろよ
-----
いままでの常識では、創薬は約10年の時間がかかり、コンピュータの役割は候補薬をフィルタリングすることに、1〜2年をかけて貢献していた。だが、新型コロナウイルスは即応性が必要であり、それに対して成果をあげることができた。創薬研究の方法論としては活気的なものである」とコメントした。
「GROMACSは、富岳用にはチューニングをしていない。だが、GENESISをチューニングした実績をもとにすれば、GROMACSもチューニングによって、5〜10倍速くなることを見積もっている。今回は約2,000種類の評価に10日間かかったが、これが2日間で終わるようになる」とした。
多けりゃいいってもんでもないだろ
>>6
じゃあとりあえずおまえが100種類くらい候補物質あげてみろよ
じゃあとりあえずおまえが100種類くらい候補物質あげてみろよ
俺にワンパンで壊されるクセによお
20くらいまで選別しろよ
1 st.スクリーニングで2000超ならまあ普通では？
でも従来のスパコンでも2-3週で出来てた気がする
でも従来のスパコンでも2-3週で出来てた気がする
これでプリコネやってもいい？
>>4
そりゃコロナウイルスの塩基配列（数兆桁）を１桁から順番に数兆桁を並び替えて
あらゆる薬のコード配分（これもまた数兆桁）もまた同じ操作をして合致するかどうかを適合率として計算していくんだから
１人の人間がやったら１００年かかっても１種類もあげられないレベル
そりゃコロナウイルスの塩基配列（数兆桁）を１桁から順番に数兆桁を並び替えて
あらゆる薬のコード配分（これもまた数兆桁）もまた同じ操作をして合致するかどうかを適合率として計算していくんだから
１人の人間がやったら１００年かかっても１種類もあげられないレベル
>>10
割とマジで蓮舫のおかげだとどっかで読んだ
割とマジで蓮舫のおかげだとどっかで読んだ
やっぱり話題性のあるテーマに使うの？
はえー・・これは本当にホルホルできそうなんよ
だいぶ昔に立体の1 st.スクリーニングをオンラインゲームにして一般人にやらせようとしたプロジェクトがあってな…
>>22
結果論ではあるが蓮舫があそこで一石投じてなければ今頃予算ブクブクのゴミスパコン事業に成り下がってたと思う
結果論ではあるが蓮舫があそこで一石投じてなければ今頃予算ブクブクのゴミスパコン事業に成り下がってたと思う
二位と3倍差は糞でかいな
二位が一ヶ月かかるところを10日で終わるとかチーとやろ
二位が一ヶ月かかるところを10日で終わるとかチーとやろ
325370607372507国】雲南から稼ぎに出た労働者が「ハンタウイルス」に感染し、発症後わずか３時間あまりで死亡 (1002ﾚｽ)
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1(29): のどか ★ 04/07(火)20:27 ID:v7plhaXs9(1) AAS
新型コロナウイルスの流行のピークを過ぎたとみられる中国では、先月23日、雲南省から出稼ぎに出た労働者が、ネズミが媒介する「ハンタウイルス」に感染し、発症後わずか3時間あまりで死亡する事件があった。同僚2人も感染の疑いが持たれている。
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ハンタウイルスに感染した患者の幹細胞（CDC）
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1(29): のどか ★ 04/07(火)20:27 ID:v7plhaXs9(1) AAS
新型コロナウイルスの流行のピークを過ぎたとみられる中国では、先月23日、雲南省から出稼ぎに出た労働者が、ネズミが媒介する「ハンタウイルス」に感染し、発症後わずか3時間あまりで死亡する事件があった。同僚2人も感染の疑いが持たれている。
画像ﾘﾝｸ[jpg]:www.hazardlab.jp
ハンタウイルスに感染した患者の幹細胞（CDC）
蓮舫さんに感謝
じゃあスパコンでスパコン作ればいいじゃん
はえー
と思ったら候補かよ
と思ったら候補かよ
でも俺が水ぶっかけようとしたら土下座して許し乞うんだろ？
何がスーパーだよ
何がスーパーだよ
流石だわ。俺でもできることを平然とやってのける
>>21
エンベロープ上のタンパクの配列(〜1 Mbp程度)しか使わないし、遺伝子治療薬以外の薬にコード配列なんてない
さらに言えば遺伝子治療薬のコード配列もせいぜい10 kbp程度の長さしかない
新薬開発エアプか？
エンベロープ上のタンパクの配列(〜1 Mbp程度)しか使わないし、遺伝子治療薬以外の薬にコード配列なんてない
さらに言えば遺伝子治療薬のコード配列もせいぜい10 kbp程度の長さしかない
新薬開発エアプか？
SARS、MARSですらワクチンできてないのにさ
口ばっかだな
口ばっかだな
プログラムの最適化したIT奴隷が凄いという話？
チョンモメン嫉妬しまくりで草
>>34
そんな簡単なら何で薬が未だに出来てないの？
そんな簡単なら何で薬が未だに出来てないの？
時報はもうイヤだー
富岳「ア、アビガンで・・・（忖度）」
実際効くのかどうかやで
SARSですらワクチン無かったんだがどうなるやら
お前らが考える選別 本棚の本をタイトルだけ見て、選別する
一般人が考える選別 本棚の本を隅から隅までとことん熟読して、選別する
一般人が考える選別 本棚の本を隅から隅までとことん熟読して、選別する
スパコン最大の障害は人間
スパコンがいくら論理解をアウトプットしても人間が採用しなけりゃそれまで
「アビガンが入ってないじゃないか！やり直させろ！」
スパコンがいくら論理解をアウトプットしても人間が採用しなけりゃそれまで
「アビガンが入ってないじゃないか！やり直させろ！」
分散コンピューティングの方が上じゃなかったか
昔あったセチ@なんとかで特効薬見つけられたんけ？
2000下手な鉄砲数打ちゃ当たる
10日も掛かっててわろたw
嫌儲に新薬開発の先生おるんやな
>>38
候補出して合成したら終わりとはいかないから
既存の薬品も10年以上、ものによっちゃ30年とかかけて作られてるけど、候補物質のスクリーニング期間は長くても3年程度
候補出して合成したら終わりとはいかないから
既存の薬品も10年以上、ものによっちゃ30年とかかけて作られてるけど、候補物質のスクリーニング期間は長くても3年程度
ジャジャ麺！冷麺！南部煎餅！わんこそば！前沢牛！
日本はこのコンピュータ信用してないんじゃなかった？
満員電車が危険って出たのに無視してるんでしょ？
満員電車が危険って出たのに無視してるんでしょ？
他のスパコンでも1700くらいはみつけそう(´・ω・｀)
日本国民はこれがうまく行ったら蓮舫に土下座して謝れよ糞メディアもちゃんと開発エピソード載せろよ
>>10
他がもっとすごいスパコンを開発中でランキング発表のタイミングが良かっただけ
他がもっとすごいスパコンを開発中でランキング発表のタイミングが良かっただけ
スパコンを使わなくても、世界はとっくに気付いていたわけか
https://r.nikkei.com/article/DGXMZO61137980T00C20A7EA5000?s=1
この結果、治療薬として有望だと考えられる数十種類を絞り込むことができた。
この中には、新型コロナ向けに世界で臨床試験（治験）が進む薬剤が12種含まれていた。
いずれも寄生虫の薬である「ニクロサミド」や「ニタゾキサニド」などで、ニタゾキサニドは既に米国やメキシコで治験が進行中だ。
奥野教授は「富岳の計算でリストアップした中に、治験が進行中の薬剤が含まれていたことは、計算が正しいことを示唆している」と話す。
https://r.nikkei.com/article/DGXMZO61137980T00C20A7EA5000?s=1
この結果、治療薬として有望だと考えられる数十種類を絞り込むことができた。
この中には、新型コロナ向けに世界で臨床試験（治験）が進む薬剤が12種含まれていた。
いずれも寄生虫の薬である「ニクロサミド」や「ニタゾキサニド」などで、ニタゾキサニドは既に米国やメキシコで治験が進行中だ。
奥野教授は「富岳の計算でリストアップした中に、治験が進行中の薬剤が含まれていたことは、計算が正しいことを示唆している」と話す。
使い勝手がいいのがミソだな富嶽は
すぐにアメリカや中国に抜かれるだろうけど1位じゃなくても売れるスパコン
蓮舫がダメ出ししてなきゃ演算だけは速いが使い勝手の悪いスパコン作り続けただろうな
すぐにアメリカや中国に抜かれるだろうけど1位じゃなくても売れるスパコン
蓮舫がダメ出ししてなきゃ演算だけは速いが使い勝手の悪いスパコン作り続けただろうな
>>26
思考停止で1位目指すとか主張してたアホ供の目を覚まさせたのはあるね
思考停止で1位目指すとか主張してたアホ供の目を覚まさせたのはあるね
薬として使える化学物質の候補出しまくるシミュレーションて
分散コンピューティングの頃から普通によくやってたよね
分散コンピューティングの頃から普通によくやってたよね
さすが猿が作ったこんぴゅーたーですわ
薬剤師なら1分だろ
富岳「満員電車は危険！」
ジャ「……」
富岳「アクリル板の仕切りは無意味！」
ジャ「……」
ジャ「感染経路不明が増えてる。なぜか分からない。」
ジャ「……」
富岳「アクリル板の仕切りは無意味！」
ジャ「……」
ジャ「感染経路不明が増えてる。なぜか分からない。」
あり過ぎて絞りきれてなくて無能じゃん
スパコンが10日で結果出せてもスパコン使う人間が数ヶ月もかけてたら意味無いよね
今まで何やってたんだ？
今まで何やってたんだ？
てかいまさら感すごすぎ
>>34
付け足しだけど、そもそも数兆(数兆桁だと意味不明すぎる)の長さのゲノムなんて高等生物にも無い
SARSウイルスのゲノムは確か30 kbpくらい
付け足しだけど、そもそも数兆(数兆桁だと意味不明すぎる)の長さのゲノムなんて高等生物にも無い
SARSウイルスのゲノムは確か30 kbpくらい
>>56
この分野はず〜っとそんな感じでしょ
この分野はず〜っとそんな感じでしょ
>>34
例えば抗体医薬品の場合、自分自身の立体構造を計算して、ウィルスのどこに結合するか3次元的かつ化合物の官能基ごとに調べていかないといけないだろ。これが簡単にできるとはいかに？
例えば抗体医薬品の場合、自分自身の立体構造を計算して、ウィルスのどこに結合するか3次元的かつ化合物の官能基ごとに調べていかないといけないだろ。これが簡単にできるとはいかに？
２位でも出来んだろ
１１日くらいで。
１１日くらいで。
富岳「岩手名物食っとけばなんとかなるやろ」
蓮舫「2位じゃだめなんですか？」
→スパコン運営「（イラッ）じゃあもっと安くて1位の作るわ」
→結果1位に
→スパコン運営「（イラッ）じゃあもっと安くて1位の作るわ」
→結果1位に
蓮舫ってもしかして有能なのでは？
ってか選別って意味あるのか
>>26
結果論じゃねーよ
利権バカの目を覚ましたのはすごい功績
結果論じゃねーよ
利権バカの目を覚ましたのはすごい功績
>>64 2000種の中から選定してるんじゃないの？
>>64
選定した上で特に効きそうな薬を順位化してるって書いてあるじゃん
1番効きそうな薬は実際は効果が無かったアビガンの二の舞にならんように名前伏せてるけど
選定した上で特に効きそうな薬を順位化してるって書いてあるじゃん
1番効きそうな薬は実際は効果が無かったアビガンの二の舞にならんように名前伏せてるけど
>>69
どこに「簡単にできる」なんて書いたよ？
ただ明らかにアホ丸出しの状態でマウント取りに行ってるのに突っ込み入れただけや
どこに「簡単にできる」なんて書いたよ？
ただ明らかにアホ丸出しの状態でマウント取りに行ってるのに突っ込み入れただけや
スパコン作ってもWindows動かないから
その中から4年かけて治験していくからな
ワクチン開発レースはとてつもなく長い
ワクチン開発レースはとてつもなく長い
多すぎわロタ
下手な鉄砲数打ちゃ当たる作戦かよ www
下手な鉄砲数打ちゃ当たる作戦かよ www
まだ2位じゃだめネタやってるやついるのかよ
全文読んだか？それでも変わらんなら国語力無さすぎ
読んでないなら一回読んでこいよ
どっか落ちてるだろうし
全文読んだか？それでも変わらんなら国語力無さすぎ
読んでないなら一回読んでこいよ
どっか落ちてるだろうし
多すぎだろ
全然絞れてねーじゃん
全然絞れてねーじゃん
富岳「東南海地震が起きる確率は50%です！」
とみたけすげえ
スパコンってシュミレーションが速いだけだからな
そのパラメーターは人間が設定するわけで
結局は人間の判断で決まる
そのパラメーターは人間が設定するわけで
結局は人間の判断で決まる
>>44
そういうこと
特に日本人は人災畑だから
そういうこと
特に日本人は人災畑だから
ジャップのアビガンどうなったんだよ
2000って逆に馬鹿だろ
1種類に絞れ無能
>>67
人間で750メガバイトだからな
CD-Rにギリ焼ける
人間で750メガバイトだからな
CD-Rにギリ焼ける
机上の計算が得意なお前らみたいだな
自分いきます
イベルメクチンが最強という結果は出とるんや
絞りきれてねぇ
そもそも医療薬って1万種類程らしいがほとんど絞れてないんじゃないか…？
そんなに大量に選んだら選別してるとは言わんやろ
昔に流行っていた解析プロジェクトなんかもスパコンに任したら一瞬で終わるんか？
自称プログラマーがブヒブヒ言ってて草
マジで嫌儲ってソース読まないのな
え、嫌儲って頭やばいやつ多くね？
2000種類の中から候補を選んだんでしょ？
俺が間違ってるの？もしかしてここってバカの集まりだった？
2000種類の中から候補を選んだんでしょ？
俺が間違ってるの？もしかしてここってバカの集まりだった？
この記事大丈夫か本当に
薬学の専門家査読したの？
薬学の専門家査読したの？
ＭＤって普通なん？QM/MMとかやらんの？
>>92
そもそもサンガー法すらない時代に力技でヒトゲノム決定できるくらいなんだから、マトモな頭があればせいぜい10億やそこらまでって分かるとと思うんだがなぁ…
そもそもサンガー法すらない時代に力技でヒトゲノム決定できるくらいなんだから、マトモな頭があればせいぜい10億やそこらまでって分かるとと思うんだがなぁ…
分散より素早く一つ一つの宿題こなせるのは良いのかもね
来月までには2億個の治療薬候補を選別してくれる
てかこれ効くんじゃねってのを絞ってからやってる国は早いだろうな
神戸は医学研究都市として役に立ってるな。
STAP細胞の汚名返上や！
STAP細胞の汚名返上や！
嘘だッ！！！
蓮舫は順位にこだわるより研究者が使いやすいスパコンを作ることが大事なのでは？って発言してるんだよね
まさしくその通りで富岳もそのコンセプトで作られてる
世界1位はその結果に付随したものでしかない
まさしくその通りで富岳もそのコンセプトで作られてる
世界1位はその結果に付随したものでしかない
増やすのは楽だけど、減らすのが大変だろ
多ければいいとかおかしい
どうせ奴隷が検証しなくちゃならないんだから
多ければいいとかおかしい
どうせ奴隷が検証しなくちゃならないんだから
その能力を生かしても新薬は作れないんだろ？
そう考えると今ってなかなか大変な事態なんだなって思うな
そう考えると今ってなかなか大変な事態なんだなって思うな
